微生物海洋学实验室目前有7名教师，其中1名教授，6名副教授，另有2名博士后。实验室主要研究方向：1）海洋微生物的生物地球化学作用（包括微生物在海洋环境中的时空分布格局及环境响应，海洋微生物在碳循环、氮循环、硫循环中的作用等）；2）海洋细菌的群体感应及群体感应淬灭（包括细菌密度感应对颗粒有机碳降解的调控作用）；3）海洋微生物的分离鉴定及资源开发（包括海洋微生物分离培养新技术的建立、新物种的分类鉴定、菌种库建设以及酶资源开发等）。

        近三年研究成果包括：1）首次发现海洋细菌能够合成“冷室气体”DMS的前体物质DMSP，解析了细菌合成DMSP的通路，并揭示了超深渊细菌可利用二甲基丙酸内盐（DMSP）抵抗高静水压力，指出异养细菌是深渊海水和沉积物中DMSP的重要生产者；2）发现烃类降解菌在马里亚纳海沟底层水出现勃发，并在深渊底部沉积物中鉴定出了大量生物来源烷烃，指出烷烃可能是万米水体微生物的重要“燃料”；3）发现深渊海沟水体中的氨氧化古菌可活跃参与氨氧化和碳固定，并演化出特殊的生存机制（如特殊的渗透保护剂及能量代谢途径等）以适应深渊极端环；4）揭示了近海底栖生境微生物的群落构建机制，提出了群落构建过程影响物种互作模式的新观点。以上科学发现获得了领域内专家的一致认可，相关研究成果分别发表于顶级杂志Nature Microbiol、Nature Commun、ISME J、Microbiome等上。