原生动物学研究室(研究室主页链接请点击:http://sxcy.ouc.edu.cn/lplb/
Laboratory of Protozoology
Team Leader: Prof. Weibo SONG                  

研究方向


空格围绕纤毛虫原生动物的多样性、细胞学、表观遗传学、基因进化、系统发育等基础生物学问题,主要研究包括:(1)聚焦在我国温带、亚热带-热带沿海自由生活类群,研究其区系、群落结构、生态学功能与地位、时空与地理分布;(2)探讨旋唇纲等高等分化类群无性生殖期间细胞器结构及模式的形成与个体发育;(3)探讨纤毛门内各纲--科级等高阶阶元间的亲缘关系及大尺度的系统发育与演化;(4)以四膜虫为材料,探讨以组蛋白翻译后修饰为主的表观遗传信息对基因表达和复制的调控机制;(5)开展纤毛虫各代表类群的DNA建库、纤毛虫学基因条形码技术的构建、标记性基因测序、纤毛虫大小核的基因进化及重要类群的组学信息分析。


研究队伍


     

 宋微波 院士,博士生导

 E-mail: wsong@ouc.edu.cn  

 Tel0532-82032283

 Resume


 

  


     

 胡晓钟 教授,博士生导

 E-mail: xiaozhonghu@ouc.edu.cn  

 Tel0532-82031610

 Resume



   



     

 高珊 教授,博士生导

 E-mail: shangao@ouc.edu.cn  

 Tel0532-82031935

 Resume



   



     

 高凤 副教授,博士生导

 E-mail: gaof@ouc.edu.cn  

 Tel0532-82031676

 Resume



   



     

 马洪刚 工程师

 E-mail: mahg@ouc.edu.cn  

 Tel0532-82032606

 


   

     




 刘宇杰 工程师

 E-mail: liuyujie@ouc.edu.cn  

Tel13045026889

  





原生动物学团队(研究室)毕业生一览表

姓名

毕业时间

本室所获学位

工作单位或博士就读-博士后工作学校

E-mail

施心路

1997 (博士)

杭州师范大学

shixl56@163.com

类彦立

1997 (硕士)

中科院海洋研究所

leiyanli@ms.qdio.ac.cn

徐奎栋

1999 (博士)

中科院海洋研究所

kxu@ms.qdio.ac.cn

赵元莙

2000 (博士)

重庆师范大学

zhaoyuanjuncqnu@126.com

张绍丽

2000 (硕士)

国家海洋局

zhangshaoli2688@163.com

马宏伟

2002 (博士)

University of Oklahoma Health Sciences 

Center (美国)

Hongwei-ma@ouhsc.edu

mhongwei@hotmail.com

陈子桂

2002 (博士)

香港中文大学

zigui.chen@cuhk.edu.hk

zigui.chen@gmail.com

胡晓钟

2002 (博士)

中国海洋大学

xiaozhonghu@ouc.edu.cn

许恒龙

2003 (博士)

中国海洋大学

xuhl@ouc.edu.cn

邱彦涛

2003 (硕士)

中国海洋大学

ytqiu@ouc.edu.cn

商慧敏

2004 (博士)

香港中文大学

huiminshang@gmail.com

付崇罗

2004 (博士)

聊城大学

fuchongluo@lcu.edu.cn

张武昌

2005 (博士后)

中科院海洋研究所

wuchangzhang@163.com

季道德

2005 (博士)

烟台大学

daodeji@126.com

龚 骏

2005 (博士)

中山大学

gongj27@mail.sysu.edu.cn

林晓凤

2005 (博士)

华南师范大学

xlin@scnu.edu.cn

任素莲

2005 (博士)

中国海洋大学

slren@ouc.edu.cn

朱明壮

2005 (硕士)

中国海洋大学

akfs@ouc.edu.cn

孙萍

2007 (博士)

厦门大学

psun@xmu.edu.cn

徐大鹏

2007 (博士)

厦门大学

dapengxu@xmu.edu.cn

李丽芳

2007 (博士)

山东大学

qd_liliy@sina.com

马洪钢

2007 (硕士)

中国海洋大学

mahonggang@ouc.edu.cn

龙红岸

2007 (硕士)

中国海洋大学

longhongan@ouc.edu.cn

邵晨

2008 (博士)

西安交通大学

andrews1201@hotmail.com

李继秋

2009 (博士后)

华南师范大学

jqli@scnu.edu.cn

郭文波

2009 (博士)

国家海洋科学研究中心 (青岛)

gwb9729@hotmail.com

陈相瑞

2009 (博士)

宁波大学

xiangruichen@126.com

苗苗

2009 (博士)

中国科学院大学(北京)

doublemiao@126.com

李俐琼

2009 (博士)

中国农业大学(烟台)

lilyjone_new@163.com

王艳刚

2009 (博士)

新华社北京分社

wangyangang2001@163.com

伊珍珍

2009 (博士)

华南师范大学

zyiscnu@sina.com

代仁海

2009 (硕士)

国家海洋科学研究中心(青岛)

drh@nocq.org

杨金鹏

2009 (硕士)

中山大学

yangjp8@mail.sysu.edu.cn

高珊

2011 (博士)

中国海洋大学

shangao@ouc.edu.cn

范鑫鹏

2011 (博士)

华东师范大学

xpfan@bio.ecnu.edu.cn

潘宏博

2011 (博士)

上海海洋大学

hbpan@shou.edu.cn

姜佳枚

2011 (博士)

上海海洋大学

capitata@163.com

张倩倩

2012 (博士)

中科院烟台海岸带研究所

qqzhang@yic.ac.cn

黄洁

2012 (博士)

中科院水生生物研究所

jiehuang1228@163.com

姜 勇

2012 (博士)

中国海洋大学

yongjiang@ouc.edu.cn

刘西汉

2012 (硕士)

河北省科学院地理科学研究所

xihan_ouc@126.com

潘 莹

2012 (硕士)

河海大学

youyun55555@163.com

沈 卓

2012 (硕士)

中山大学

shenzhuo@mail.sysu.edu.cn

刘炜炜

2013 (博士后)

中科院南海海洋研究所

wwliu@scsio.ac.cn

陈旭淼

2013 (博士)

中科院海洋研究所

xchen@qdio.ac.cn

高凤

2013 (博士)

中国海洋大学

gaof@ouc.edu.cn

许媛

2013 (博士)

华东师范大学

yxu@sklec.ecnu.edu.cn

hdxy8626@163.com

赵璐

2013 (硕士)

日照职业技术学院

passion_1987@126.com

董俊

2014 (博士)

深圳朗诚科技股份有限公司

dongjun860920@163.com

赵研

2014 (博士)

中科院生态环境研究中心

yanzhao@rcees.ac.cn

潘旭明

2014 (博士)

哈尔滨师范大学

pppppp206@126.com

刘安

2014 (硕士)

Ghent University (比利时)

niuniu19900415@163.com

张伟

2015 (博士)

中山大学

zhangwei_shandong@126.com

樊阳波

2015 (博士)

深圳市标准化技术研究院

cookies.1989@163.com

李佳楣

2015 (博士)

中国海洋大学

lijiamei825@163.com

王璞

2015 (硕士)

University of Minnesota (美国)

wang5922@umn.edu

李凤超

2016 (博士后)

河北大学

lifengchao2000@126.com

陈凌云

2016 (博士)

西北师范大学

linxiachenlingyun@163.com

赵晓璐

2016 (博士)

University of Michigan (美国)

xiaolu_zhao@163.com

芦晓腾

2016 (硕士)

University of Innsbruck (奥地利)

leonardolxt@126.com

宋 雯

2017 (博士)

中国海洋大学

songwenpower@163.com

阎 莹

2017 (博士)

Smith College (美国)

qilin_238@163.com

陈 晓

2017 (博士)

Columbia University (美国)

seanchen607@gmail.com

罗晓甜

2018 (博士)

中科院水生生物研究所

luoxiaotian512@163.com


承担课题

国家自然科学基金重点项目:南中国海纤毛虫原生动物的区系与多样性研究(2015-2019

国家自然科学基金面上项目:黄海沿岸的核残亚纲纤毛虫原生动物研究(2013-2016

国家自然科学基金国际合作项目:纤毛虫多样性研究的合作网络建立2012-2016

国家自然科学基金面上项目:黄海近岸厌氧环境纤毛虫的生物多样性研究(2016-2019

国家自然科学基金面上项目:南中国海叶咽纲和前口纲纤毛虫原生动物的研究(2015-2017

国家自然科学基金优秀青年基金项目:利用纤毛虫模式动物四膜虫对表观遗传学的研究(2016-2018

国家自然科学基金面上项目:以纤毛虫原生动物-嗜热四膜虫为模式:DNA复制延伸相关的表观遗传学研究2015-2017

国家自然科学基金青年项目:海洋纤毛虫具沟急游虫的基因组重组过程与进化探讨(2015-2017

山东省自然科学基金青年项目:表观遗传信息对复制延伸过程及脆性位点表达的调控研究(2015-2017


近期论文及成果

Gao, S., Liu, Y. (2012). Intercepting noncoding messages between germline and soma. Genes & development, 26(16), 1774-1779.

Gao, S., Xiong, J., Zhang, C., Berquist, B. R., Yang, R., Zhao, M., Molascon, A. J., Kwiatkowski, S. Y., Yuan, D., Qin, Z., Wen, J., Kapler, G. M., Andrews, P. C., Miao, W., Liu, Y. (2013). Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & Development, 27, 1662-1679.

Huang, J., Chen, Z., Song, W.*,Berger, H. (2014). Three-gene based phylogeny of the Urostyloidea (Protista, Ciliophora, Hypotricha), with notes on classification of some core taxa. Molecular phylogenetics and evolution, 70, 337-347.

Gao, F., Katz, L. A., Song, W.* (2014). Genome structure drives patterns of gene family evolution in ciliates, a case study using Chilodonella uncinata (Protista, Ciliophora, Phyllopharyngea). Evolution, 68, 2287-2295.

Fan, Y., Pan, Y., Huang, J., Lin, X., Hu, X.*, Warren, A. (2014). Molecular phylogeny and taxonomy of two novel brackish water hypotrich ciliates, with the establishment of a new genus, Antiokeronopsis gen. n.(Ciliophora, Hypotrichia). Journal of Eukaryotic Microbiology, 61, 449-462.

Gao, S., Lu, L., Bai, Y., Zhang, P., Song, W.,Duan, C. (2014). Structural and functional analysis of amphioxus HIFα reveals ancient features of the HIFα family. The FASEB Journal, 28, 1880-1890.

Gao F., Gao S.*,Wang P., Katz L. A., Song W. (2014) Phylogenetic analyses of cyclidiids (Protista, Ciliophora, Scuticociliatia) based on multiple genes suggest their close relationship with thigmotrichids. Molecular Phylogenetics and Evolution, 75, 219-226.

Gao F., Katz L. A. (2014) Phylogenomic analyses support the bifurcation of ciliates into two major clades that differ in properties of nuclear division. Molecular Phylogenetics and Evolution, 70, 240-243.

Chen, X., Gao, F., Al-Farraj, S. A., Al-Rasheid, K. A., Xu, K, Song, W.* (2015). Morphology and morphogenesis of a novel mangrove ciliate, Sterkiella subtropica sp. nov.(Protozoa, Ciliophora, Hypotrichia), with phylogenetic analyses based on small-subunit rDNA sequence data. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 65, 2292-2303.

Liu, W., Yi, Z., Lin, X., Li, J., Al-Farraj, S. A., Al-Rasheid, K. A., Song, W.* (2015). Morphology and molecular phylogeny of three new oligotrich ciliates (Protozoa, Ciliophora) from the South China Sea. Zoological Journal of the Linnean Society, 174, 653-665.

Liu, W., Yi, Z., Xu, D., Clamp, J. C., Li, J., Lin, X., Song, W.* (2015). Two new genera of planktonic ciliates and insights into the evolution of the family Strombidiidae (Protista, Ciliophora, Oligotrichia). Plos One DOI:10.1371 /journal.pone.0131726.

Pan, H., Hu, J., Jiang, J., Wang, L., Hu, X.* (2015). Morphology and Phylogeny of Three Pleuronema Species (Ciliophora, Scuticociliatia) from Hangzhou Bay, China, with Description of Two New Species, P. binucleatum n. sp. and P. parawiackowskii n. sp. Journal of Eukaryotic Microbiology,63, 287-298.

Luo, X., Gao, F., Al-Rasheid, K. A., Warren, A., Hu, X.*, Song, W. (2015). Redefinition of the hypotrichous ciliate Uncinata, with descriptions of the morphology and phylogeny of three urostylids (Protista, Ciliophora). Systematics and Biodiversity, 13, 455-471.

Qu, Z., Pan, H., Hu, X.*, Li, J., Al-Farraj, S. A., Al-Rasheid, K. A., Yi, Z. (2015). Morphology and Molecular Phylogeny of Three Cyrtophorid Ciliates (Protozoa, Ciliophora) from China, including Two New Species, Chilodonella parauncinata sp. n. and Chlamydonella irregularis sp. n. Journal of Eukaryotic Microbiology, 62, 267-279.

Song, W., Zhao, X., Liu, W., Hu, X.*, Al-Farraj, S. A., Al-Rasheid, K. A., Song, W., Warren, A. (2015). Biodiversity of oligotrich ciliates in the South China Sea: description of three new Strombidium species (Protozoa, Ciliophora, Oligotrichia) with phylogenetic analyses. Systematics and Biodiversity, 13, 608-623.

Gao F., Roy S. W., Katz L. A. (2015) Analyses of alternatively processed genes in ciliates provide insights into the origins of scrambled genomes and may provide a mechanism for speciation. mBio 6:e01998-14.

Huang, J., Luo, X., Bourland, W. A., Gao, F.*, Gao, S.*(2016). Multigene-based phylogeny of the ciliate families Amphisiellidae and Trachelostylidae (Protozoa: Cilioph-ora: Hypotrichia). Molecular phylogenetics and evolution, 101, 101-110.

Gao, F., Warren A., Zhang Q., Gong J., Miao M., Sun P., Xu D., Huang J., Yi Z., Song W.* (2016) The all-data-based evolutionary hypothesis of ciliated protists with a revised classification of the phylum Ciliophora (Eukaryota, Alveolata). Scientific Reports. 6, doi: 10.1038/ srep24874. 



其他

原生动物学研究室网址http://scxy.ouc.edu.cn/lplb/