为响应中西部高等教育振兴计划,推进东部高校对口支援西部高校计划中的实践育人工作,在中国海洋大学与塔里木大学的前期良好合作基础上,2024年8月14至17日,由中国海洋大学水产学院和海洋生物多样性与进化研究所共同主办、面向青年科研人员的《生物大数据分析》研究生实践课程首次走出海大校园,在塔里木大学成功开设。尽管课程密集、部分授课成员身体不适且天气炎热,但授课团队和学员们经过四天的共同努力,仍然取得了良好的培训效果。该培训班由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织,全程得到了华为技术有限公司、翌圣(生物)科技有限公司等的大力协助。本培训课程最初由教育部-华为技术有限公司-中国海洋大学三方支持的“产学合作协同育人-新工科建设项目(A类)”(2020)立项建设,至今已开设6期,累计培训学员238人。
全体合影
组学技术为生物学提供了一把牛刀,但产出的大量数据却因分析软硬件技术门槛高,外包服务商良莠不齐,导致数据堆积和缺乏深度个性化分析。授课团队期望为非生物信息学背景实验室扫清部分技术障碍,与零基础研究生分享针对大数据分析的学习方法与操作技术,结课时可独立进行基本的生物大数据分析和结果解释,以修课学生为桥梁,为有需求的实验室引入技术火种,最终推动泛生命学科研究水平的整体提升。
一个人可以走很快,一群没有私心的人才能走很远。分享利他,太多人只是放在口头上,而缺乏行动。技术总会过时,但通过分享技术结下的友谊却可以持续一生。授课团队由进化所高性能服务器运维团队、进化基因组学课题组全体师生和本科生志愿者共计10人组成。授课团队在前五期的授课基础上,进行了精心的筹备,更新了课程内容,集中研讨了授课形式和全流程资源配置,再加上专业指导和多方赞助支持,延续了之前完整的授课体系。1:3的高师生比也保证了对学员实际操作的及时对接,修课学员还需自学指定的Linux教材且由授课团队成员一对一严格考核掌握程度,最终有25名学员完成全部培训内容并获得水产学院、进化所共同认证的结业证书,绝大多数学员来自不同实验室。
授课团队行前准备
培训过程中,学员们热情高涨,操作认真,并结合自身研究方向积极提问,与授课人员及助教有着良好的互动。操作内容涵盖了从科研方法论、虚拟机和服务器的使用与软件安装、测序原理、数据预处理、基因组组装注释、基于转录组测序的表达量差异分析、扩增子分析、宏基因组学、数据可视化等生物大数据分析基础理论与上手操作。
授课团队、塔里木大学生命科学与技术学院领导班子和优秀学员合影
经过四天全天候的上手集训,学员们不仅了解了高性能服务器的架构体系及生态环境,也掌握了生物大数据分析相关技能及学习方法,能进行分子、基因组和群落各层次的基本大数据分析,并扩大了自己的科研朋友圈。其中李超、杨果、杨秋红三
学员表现突出,被评为白金学员,其余同学被评为黄金学员。
“为实验室引入技术火种,打造同学心目中的实用型金课”是《生物大数据分析》公益培训班的开设初衷,也是授课团队将一直秉承的理念。相信未来的《生物大数据分析》将会不断升级,为更多的学员带来掌握上手技能的机会,成为同学们心目中的实用型金课!也希望本培训课程能抛砖引玉,启发更多课程改革,共同推进中国研究生教育质量的持续提升。
证书编号 | 姓名 | 导师 | 学校 |
LOEG-24-214 | 韩子凌 | 王彦芹 | 塔里木大学 |
LOEG-24-215 | 侯亚欣 | 杨赵平 | 塔里木大学 |
LOEG-24-216 | 菅佳鑫 | 杨赵平 | 塔里木大学 |
LOEG-24-217 | 刘美琳 | 韩占江 | 塔里木大学 |
LOEG-24-218 | 刘蕊琪 | 张晶 | 塔里木大学 |
LOEG-24-219 | 陆忻子墨 | 金双侠 | 塔里木大学 |
LOEG-24-220 | 聂川鸿 | 张晶 | 塔里木大学 |
LOEG-24-221 | 石佳荣 | 龙红岸 | 中国海洋大学 塔里木大学 |
LOEG-24-222 | 宋佳 | 刘艳萍 | 塔里木大学 |
LOEG-24-223 | 宋双飞 | 黄文娟 | 塔里木大学 |
LOEG-24-224 | 孙志宾 | 万传星 | 塔里木大学 |
LOEG-24-225 | 汤驰 | 格明古丽·木哈台 | 塔里木大学 |
LOEG-24-226 | 汪赛月 | 刘琴 | 塔里木大学 |
LOEG-24-227 | 王祥媛 | 刘逸泠 | 塔里木大学 |
LOEG-24-228 | 王业林 | 夏占峰 | 塔里木大学 |
LOEG-24-229 | 文凤 | 夏占峰 | 塔里木大学 |
LOEG-24-230 | 徐靖辰 | 金双侠 | 塔里木大学 |
LOEG-24-231 | 杨晨晨 | 韩春梅 | 塔里木大学 |
LOEG-24-232 | 杨睿智 | 李连瑞 | 塔里木大学 |
LOEG-24-233 | 张博阳 | 陈水红 | 塔里木大学 |
LOEG-24-234 | 周美 | 张玲 | 塔里木大学 |
LOEG-24-235 | 厉彦浩 | 刘书东 | 塔里木大学 |
LOEG-24-241 | 李超 | 王彦芹 | 塔里木大学 |
LOEG-24-242 | 杨果 | 罗晓霞 | 塔里木大学 |
LOEG-24-243 | 杨秋红 | 朱丽霞 | 塔里木大学 |