微生物海洋学实验室目前有7名教师，其中3名教授，4名副教授，以及1名博士后。实验室主要研究方向涉及：

1）海洋微生物驱动的生物地球化学过程（包括微生物在海洋环境中的时空分布格局及环境响应，海洋微生物在碳循环、氮循环、硫循环中的作用等）；

2）海洋微生物的分离鉴定及资源开发（包括海洋微生物分离培养新技术的建立、新物种的分类鉴定、菌种库建设以及酶资源开发等）。

近年来的主要研究成果包括：

1）首次发现海洋细菌能够合成“冷室气体”DMS的前体物质DMSP，解析了细菌合成DMSP的通路，并揭示了超深渊细菌可利用二甲基丙酸内盐（DMSP）抵抗高静水压力，指出异养细菌是深渊海水和沉积物中DMSP的重要生产者；

2）发现了海洋细菌中广泛存在的一种新型DMS产生酶MddH，证实硫化氢和甲硫醇的甲基化是海洋DMS的重要来源之一，此外还发现了海洋细菌及浮游藻类中的一种新型双结构域的DMSP合成酶DsyGD；

3）揭示了马里亚纳海沟深渊环境中不同细菌类群的特殊代谢机制，包括发现烃类降解菌在马里亚纳海沟底层水出现勃发，指出烷烃可能是万米水体微生物的重要“燃料”；发现深渊海沟水体中的氨氧化古菌可活跃参与氨氧化和碳固定，并演化出特殊的生存机制以适应深渊极端环境；揭示了深渊拟杆菌类群的特殊多糖降解机制；

4）揭示了近海底栖生境微生物的群落构建机制，提出了群落构建过程影响物种互作模式的新观点。

　　以上科学发现获得了领域内专家的一致认可，相关研究成果分别发表于顶级杂志Nature Microbiol （共三篇）、Nature Commun、ISME J、Microbiome（共四篇）等。