2025年11月29―30日、12月6―7日,由中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所和水产学院共同主办,面向青年科研人员的《生物大数据分析》公益培训暨实践操作课在海大鱼山校区成功开设。尽管课程密集、流感盛行且空间有限,但授课团队和学员们牺牲周末时间,经过四天的共同努力,仍然取得了良好的培训效果。该培训由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织,全程得到了南京诺唯赞生物科技股份有限公司、北京诺禾致源科技股份有限公司、生工生物工程(上海)股份有限公司、北京景行锐创软件有限公司等的大力协助。本培训课程最初由教育部-华为技术有限公司-中国海洋大学三方支持的“产学合作协同育人-新工科建设项目(A类)”(2020)立项建设,迄今已开设8期,累计培训学员350人。

全体合影
组学技术为生物学提供了一把牛刀,但产出的大量数据却因分析软硬件技术门槛高,外包服务商良莠不齐,导致数据堆积和缺乏深度个性化分析。授课团队期望为非生物信息学背景实验室扫清部分技术障碍,与零基础研究生分享针对大数据分析的学习方法与操作技术,结课时可独立进行基本的生物大数据分析和结果解释,以修课学生为桥梁,为有需求的实验室引入技术火种,最终推动泛生命学科研究水平的整体提升。
一个人可以走很快,一群没有私心的人才能走很远。分享利他,太多人只是放在口头上,而缺乏行动。技术总会过时,但通过分享技术结下的友谊却可以持续一生。授课团队由进化所高性能服务器运维团队、进化基因组学课题组全体师生和本科生志愿者共计18人组成。授课团队在前7期的授课基础上,进行了精心的筹备,更新了课程内容,集中研讨了授课形式和全流程资源配置,再加上专业指导和多方赞助支持,延续了之前完整的授课体系。近1:3的高师生比也保证了对学员实际操作的及时对接,修课学员还需自学指定的Linux教材,并在个人电脑上安装所有课程相关软件,之后由授课团队成员一对一严格考核掌握程度,最终有59名学员完成全部培训内容并获得水产学院和进化所共同认证的结业证书,绝大多数学员来自不同实验室。

授课团队部分成员
培训过程中,学员们热情高涨,操作认真,并结合自身研究方向积极提问,与授课人员及助教有着良好的互动。操作内容涵盖了从科研方法论、虚拟机和服务器的使用与软件安装、测序原理、数据预处理、基因组组装注释、基于转录组测序的表达量差异分析、扩增子分析、宏基因组学、数据可视化等生物大数据分析基础理论与上手操作。
日期 | 时间 | 课次 | 授课内容 |
11.29 (周六)
| 8:30-9:20 | 第1课 | 课程介绍与互动 |
9:30-11:30 | 第2课 | 计算机硬件发展简史 | |
13:30-15:30 | 第3课 | 虚拟机使用、重测序数据比对等 | |
15:40-17:40 | 第4课 | 数据库使用、脚本案例实际操作-预热 | |
18:30-21:30 | 第5课 | 生物大数据的产出与预处理 | |
11.30 (周日) | 8:30-11:30 | 第6课 | 扩增子常识与分析 |
13:30-14:10 | 第7课 | 浅谈组学热点技术与应用(诺禾) | |
14:30-17:00 | 第8课 | 细菌基因组的组装和注释 | |
18:30-21:30 | 第9课 | 数据可视化-R绘图、系统发育树构建等 | |
12.06 (周六) | 8:30-11:30 | 第10课 | 真核生物基因组的从头组装 |
11:40-12:20 | 第11课 | 二代测序一站式解决方案(诺唯赞) | |
13:30-17:00 | 第12课 | 真核生物基因组的结构与功能注释 | |
18:30-21:00 | 第13课 | 基于转录组测序的基因差异表达分析 | |
12.07 (周日) | 8:30-12:30 | 第14课 | 宏基因组常识与分析 |
14:00-14:40 | 第15课 | 真核转录组及多组学联合应用(生工) | |
14:50-17:20 | 课程总结 | 课程结业与调查反馈与合影 |
经过四天全天候的上手集训,学员们不仅了解了高性能服务器的架构体系及生态环境,也掌握了生物大数据分析相关技能及学习方法,能进行分子、基因组和群落各层次的基本大数据分析,并扩大了自己的科研朋友圈。其中李雪淇、余典、王焱哲、刘小强、孙宏斌、赵梓伊、胡蔚然、史文哲八名学员表现突出,被评为优秀学员。

“为实验室引入技术火种,打造同学心目中的实用型金课”是《生物大数据分析》公益培训班的开设初衷,也是授课团队将一直秉承的理念。相信未来的《生物大数据分析》将会不断升级,为更多的学员带来掌握上手技能的机会,成为同学们心目中的实用型金课!也希望本培训课程能抛砖引玉,启发更多课程改革,共同推进中国研究生教育质量的持续提升。
证书编号 | 姓名 | 单位 | 导师 |
LOEG-8-292 | 褚媛媛 | 中国海洋大学 | 刘岩 |
LOEG-8-293 | 段嘉宝 | 中国海洋大学 | 董波 |
LOEG-8-294 | 康云思 | 中国海洋大学 | 独立教师 |
LOEG-8-295 | 李绍凡 | 中科院海洋研究所 | 孙松 |
LOEG-8-296 | 李雪淇 | 中国海洋大学 | 李昀 |
LOEG-8-297 | 刘仕濠 | 中国海洋大学 | 刘阳 |
LOEG-8-298 | 路化乐 | 塔里木大学 | 聂竹兰 |
LOEG-8-299 | 石佩峰 | 中国海洋大学 | 茅云翔 |
LOEG-8-300 | 史文哲 | 中科院海洋研究所 | 沙忠利 |
LOEG-8-301 | 王立博 | 中国海洋大学 | 田源 |
LOEG-8-302 | 魏羽辰 | 中国海洋大学 | 董波 |
LOEG-8-303 | 张嘉晖 | 中国海洋大学 | 迟恒 |
LOEG-8-304 | 华堇熙 | 中国海洋大学 | 李昀 |
LOEG-8-305 | 王正伟 | 塔里木大学 | 聂竹兰 |
LOEG-8-306 | 樊弘 | 宁波大学 | 朱鸶 |
LOEG-8-307 | 钱卓 | 中国海洋大学 | 律倩倩 |
LOEG-8-308 | 刘欣 | 中科院海洋研究所 | 毕允晨 |
LOEG-8-309 | 蒋雯雯 | 青岛农业大学 | 独立教师 |
LOEG-8-310 | 颜乐意 | 中国海洋大学 | 倪刚 |
LOEG-8-311 | 赵梓伊 | 中国海洋大学 | 齐鑫 |
LOEG-8-312 | 赵雪彤 | 宁波大学 | 陈相瑞 |
LOEG-8-313 | 殷雨萱 | 内蒙古大学 | 白杨 |
LOEG-8-314 | 常子涵 | 中国海洋大学 | 谢海波 |
LOEG-8-315 | 陈语晴 | 中国海洋大学 | 李琪 |
LOEG-8-316 | 崔一戈 | 中国海洋大学 | 李甍 |
LOEG-8-317 | 付知洋 | 中国海洋大学 | 宋协法 |
LOEG-8-318 | 韩麒凝 | 中国海洋大学 | 潘鲁青 |
LOEG-8-319 | 胡蔚然 | 中国海洋大学 | 包锐 |
LOEG-8-320 | 黄荣杰 | 中国海洋大学 | 李丽 |
LOEG-8-321 | 靳书磊 | 中国海洋大学 | 李琪 |
LOEG-8-322 | 李睿龙 | 中国海洋大学 | 宫庆礼 |
LOEG-8-323 | 盛帅 | 中国海洋大学 | 李悦如 |
LOEG-8-324 | 万济源 | 中国海洋大学 | 姜勇 |
LOEG-8-325 | 王姝惠 | 中国海洋大学 | 王巧晗 |
LOEG-8-326 | 王焱哲 | 中国海洋大学 | 董波 |
LOEG-8-327 | 夏飞宇 | 中国海洋大学 | 王芳 |
LOEG-8-328 | 向瑞天 | 中国海洋大学 | 潘鲁青 |
LOEG-8-329 | 徐锦 | 中国海洋大学 | 宫庆礼 |
LOEG-8-330 | 余典 | 中国海洋大学 | 董云伟 |
LOEG-8-331 | 张惠茹 | 中国海洋大学 | 刘大鹏 |
LOEG-8-332 | 张晓涵 | 中国海洋大学 | 陈慕雁 |
LOEG-8-333 | 赵彬吉 | 中国海洋大学 | 李红岩 |
LOEG-8-334 | 周正璐 | 中国海洋大学 | 王晓磊 |
LOEG-8-335 | 庄兴华 | 中国海洋大学 | 绳秀珍 |
LOEG-8-336 | 刘小强 | 中国海洋大学 | 倪刚 |
LOEG-8-337 | 张文淏 | 中国海洋大学 | 李琪 |
LOEG-8-338 | 孙鑫 | 中国海洋大学 | 王杰 |
LOEG-8-339 | 王筱艾 | 中国海洋大学 | 黄六一 |
LOEG-8-340 | 周浩 | 中国海洋大学 | 隗健凯 |
LOEG-8-341 | 马真杰 | 中国海洋大学 | 邢婧 |
LOEG-8-342 | 李丹 | 中国海洋大学 | 田源 |
LOEG-8-343 | 孙宏斌 | 中国海洋大学 | 孙世春 |
LOEG-8-344 | 李竟豪 | 中国海洋大学 | 刘士凯 |
LOEG-8-345 | 李传瑞 | 中国海洋大学 | 赵呈天 |
LOEG-8-346 | 龚继航 | 中国海洋大学 | 孔令锋 |
LOEG-8-347 | 刘少辉 | 中国海洋大学 | 高珊 |
LOEG-8-348 | 李源 | 山东大学(威海) | 独立教师 |
LOEG-8-349 | 孙悦 | 山东大学(威海) | 陈晓 |
LOEG-8-350 | 王苗苗 | 华东师范大学 | 范鑫鹏 |

