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【公益活动】第8期生物大数据分析公益培训班成功开设

发布时间:2025-12-07浏览次数:10

2025112930日、1267日,由中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所和水产学院共同主办,面向青年科研人员的《生物大数据分析》公益培训暨实践操作课在海大鱼山校区成功开设。尽管课程密集、流感盛行且空间有限,授课团队和学员们牺牲周末时间,经过四天的共同努力,仍然取得了良好的培训效果。该培训由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织,全程得到了南京诺唯赞生物科技股份有限公司、北京诺禾致源科技股份有限公司、生工生物工程(上海)股份有限公司北京景行锐创软件有限公司等的大力协助本培训课程最初由教育部-华为技术有限公司-中国海洋大学三方支持的“产学合作协同育人-新工科建设项目(A类)”(2020)立项建设,迄今已开设8期,累计培训学员350人。

全体合影

组学技术为生物学提供了一把牛刀,但产出的量数据却因分析软硬件技术门槛高,外包服务商良莠不齐,导致数据堆积和缺乏深度个性化分析。授课团队期望为非生息学背景实验室扫清部分技术障碍,与零基础研究生分享针对大数据分析的学习方法与操作技术,结课时可独立进行基本的生物大数据分析和结果解释,修课学生为桥梁,为有需求的实验室引入技术火种,最终推动泛生命学科研究水平的整体提升。

一个人可以走很快,一群没有私心的人才能走远。分享利他,太多人只是放在口头上,而缺乏行动。技术总会过时,但通过分享技术结下的友谊却可以持续一生。授课团队由进化所高性能服务器运维团队、进化基因组学课题组全体师生和本科生志愿者共计18人组成。授课团队在前7授课基础上,进行了精心的筹备,更新了课程内容,集中研讨了授课形式和全流程资源配置,再加上专业指导和多方赞助支持,延续了之前完整的授课体系。1:3的高师生比也保证了对学员实际操作的及时对接,修课学员还需自学指定的Linux教材,并在个人电脑上安装所有课程相关软件,之后由授课团队成员一对一严格考核掌握程度,最终有59名学员完成全部培训内容并获得水产学院进化所共同认证的结业证书,绝大多数学员来自不同实验室。

授课团队部分成员

  培训过程中,学员们热情高涨,操作认真,并结合自身研究方向积极提问,与授课人员及助教有着良好的互动。操作内容涵盖了从科研方法论、虚拟机和服务器的使用与软件安装、测序原理数据预处理、基因组组装注释、基于转录组测序的表达量差异分析、扩增子分析、宏基因组学数据可视化等生物大数据分析基础理论与上手操作。


日期

时间

课次

授课内容

 11.29

(周六)

 

8:30-9:20

1

课程介绍与互动

9:30-11:30

2

计算机硬件发展简史

13:30-15:30

3

虚拟机使用、重测序数据比对等

15:40-17:40

4

数据库使用、脚本案例实际操作-预热

18:30-21:30

5

生物大数据的产出与预处理

 11.30

(周日)

8:30-11:30

6

扩增子常识与分析

13:30-14:10

7

浅谈组学热点技术与应用(诺禾)

14:30-17:00

8

细菌基因组的组装和注释

18:30-21:30

9

数据可视化-R绘图、系统发育树构建等

 12.06

(周六)

8:30-11:30

10

真核生物基因组的从头组装

11:40-12:20

11

二代测序一站式解决方案(诺唯赞)

13:30-17:00

12

真核生物基因组的结构与功能注释

18:30-21:00

13

基于转录组测序的基因差异表达分析

12.07

(周日)

8:30-12:30

14

宏基因组常识与分析

14:00-14:40

15

真核转录组及多组学联合应用(生工)

14:50-17:20

课程总结

课程结业与调查反馈合影

经过全天候的上手集训,学员们不仅了解了高性能服务器的架构体系及生态环境,也掌握了生物大数据分析相关技能及学习方法,能进行分子、基因组和群落各层次的基本大数据分析,并扩大了自己的科研朋友圈。其中李雪淇、余典、王焱哲、刘小强、孙宏斌、赵梓伊、胡蔚然、史文哲八学员表现突出,被评为优秀学员

“为实验室引入技术火种,打造同学心目中的实用型金课”是《生物大数据分析》公益培训班开设初衷,也是授课团队将一直秉承的理念。相信未来的《生物大数据分析》将会不断升级,为更多的学员带来掌握上手技能的机会,成为同学们心目中的实用型金课!也希望本培训课程能抛砖引玉,启发更多课程改革,共同推进中国研究生教育质量的持续提升。

证书编号

姓名

单位

导师

LOEG-8-292

褚媛媛

中国海洋大学

刘岩

LOEG-8-293

段嘉宝

中国海洋大学

董波

LOEG-8-294

康云思

中国海洋大学

独立教师

LOEG-8-295

李绍凡

中科院海洋研究所

孙松

LOEG-8-296

李雪淇

中国海洋大学

李昀

LOEG-8-297

刘仕濠

中国海洋大学

刘阳

LOEG-8-298

路化乐

塔里木大学

聂竹兰

LOEG-8-299

石佩峰

中国海洋大学

茅云翔

LOEG-8-300

史文哲

中科院海洋研究所

沙忠利

LOEG-8-301

王立博

中国海洋大学

田源

LOEG-8-302

魏羽辰

中国海洋大学

董波

LOEG-8-303

张嘉晖

中国海洋大学

迟恒

LOEG-8-304

华堇熙

中国海洋大学

李昀

LOEG-8-305

王正伟

塔里木大学

聂竹兰

LOEG-8-306

樊弘

宁波大学

朱鸶

LOEG-8-307

钱卓

中国海洋大学

律倩倩

LOEG-8-308

刘欣

中科院海洋研究所

毕允晨

LOEG-8-309

蒋雯雯

青岛农业大学

独立教师

LOEG-8-310

颜乐意

中国海洋大学

倪刚

LOEG-8-311

赵梓伊

中国海洋大学

齐鑫

LOEG-8-312

赵雪彤

宁波大学

陈相瑞

LOEG-8-313

殷雨萱

内蒙古大学

白杨

LOEG-8-314

常子涵

中国海洋大学

谢海波

LOEG-8-315

陈语晴

中国海洋大学

李琪

LOEG-8-316

崔一戈

中国海洋大学

李甍

LOEG-8-317

付知洋

中国海洋大学

宋协法

LOEG-8-318

韩麒凝

中国海洋大学

潘鲁青

LOEG-8-319

胡蔚然

中国海洋大学

包锐

LOEG-8-320

黄荣杰

中国海洋大学

李丽

LOEG-8-321

靳书磊

中国海洋大学

李琪

LOEG-8-322

李睿龙

中国海洋大学

宫庆礼

LOEG-8-323

盛帅

中国海洋大学

李悦如

LOEG-8-324

万济源

中国海洋大学

姜勇

LOEG-8-325

王姝惠

中国海洋大学

王巧晗

LOEG-8-326

王焱哲

中国海洋大学

董波

LOEG-8-327

夏飞宇

中国海洋大学

王芳

LOEG-8-328

向瑞天

中国海洋大学

潘鲁青

LOEG-8-329

徐锦

中国海洋大学

宫庆礼

LOEG-8-330

余典

中国海洋大学

董云伟

LOEG-8-331

张惠茹

中国海洋大学

刘大鹏

LOEG-8-332

张晓涵

中国海洋大学

陈慕雁

LOEG-8-333

赵彬吉

中国海洋大学

李红岩

LOEG-8-334

周正璐

中国海洋大学

王晓磊

LOEG-8-335

庄兴华

中国海洋大学

绳秀珍

LOEG-8-336

刘小强

中国海洋大学

倪刚

LOEG-8-337

张文淏

中国海洋大学

李琪

LOEG-8-338

孙鑫

中国海洋大学

王杰

LOEG-8-339

王筱艾

中国海洋大学

黄六一

LOEG-8-340

周浩

中国海洋大学

隗健凯

LOEG-8-341

马真杰

中国海洋大学

邢婧

LOEG-8-342

李丹

中国海洋大学

田源

LOEG-8-343

孙宏斌

中国海洋大学

孙世春

LOEG-8-344

李竟豪

中国海洋大学

刘士凯

LOEG-8-345

李传瑞

中国海洋大学

赵呈天

LOEG-8-346

龚继航

中国海洋大学

孔令锋

LOEG-8-347

刘少辉

中国海洋大学

高珊

LOEG-8-348

李源

山东大学(威海)

独立教师

LOEG-8-349

孙悦

山东大学(威海)

陈晓

LOEG-8-350

王苗苗

华东师范大学

范鑫鹏