2024年11.23-24、11.30-12.1,由中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所、水产学院和山东省生态学会共同主办,面向青年科研人员的《生物大数据分析》公益培训暨实践操作课在海大鱼山校区成功开设。尽管课程密集、部分授课成员身体不适且空间有限,但授课团队和学员们牺牲周末时间,经过四天的共同努力,仍然取得了良好的培训效果。该培训班由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织,全程得到了南京诺唯赞生物科技股份有限公司、北京诺禾致源科技股份有限公司、北京擎科生物科技有限公司等的大力协助。本培训课程最初由教育部-华为技术有限公司-中国海洋大学三方支持的“产学合作协同育人-新工科建设项目(A类)”(2020)立项建设,至今已开设7期,累计培训学员291人。
全体合影
组学技术为生物学提供了一把牛刀,但产出的大量数据却因分析软硬件技术门槛高,外包服务商良莠不齐,导致数据堆积和缺乏深度个性化分析。授课团队期望为非生物信息学背景实验室扫清部分技术障碍,与零基础研究生分享针对大数据分析的学习方法与操作技术,结课时可独立进行基本的生物大数据分析和结果解释,以修课学生为桥梁,为有需求的实验室引入技术火种,最终推动泛生命学科研究水平的整体提升。
一个人可以走很快,一群没有私心的人才能走很远。分享利他,太多人只是放在口头上,而缺乏行动。技术总会过时,但通过分享技术结下的友谊却可以持续一生。授课团队由进化所高性能服务器运维团队、进化基因组学课题组全体师生和本科生志愿者共计19人组成。授课团队在前6期的授课基础上,进行了精心的筹备,更新了课程内容,集中研讨了授课形式和全流程资源配置,再加上专业指导和多方赞助支持,延续了之前完整的授课体系。1:3的高师生比也保证了对学员实际操作的及时对接,修课学员还需自学指定的Linux教材,并在个人电脑上安装所有课程相关软件,之后由授课团队成员一对一严格考核掌握程度,最终有52名学员完成全部培训内容并获得水产学院、进化所、山东省生态学会共同认证的结业证书,绝大多数学员来自不同实验室。
授课团队部分成员
培训过程中,学员们热情高涨,操作认真,并结合自身研究方向积极提问,与授课人员及助教有着良好的互动。操作内容涵盖了从科研方法论、虚拟机和服务器的使用与软件安装、测序原理、数据预处理、基因组组装注释、基于转录组测序的表达量差异分析、扩增子分析、宏基因组学、数据可视化等生物大数据分析基础理论与上手操作。
课程表
教室:达尔文馆学术厅
授课团队:中国海洋大学进化基因组学课题组
经过四天全天候的上手集训,学员们不仅了解了高性能服务器的架构体系及生态环境,也掌握了生物大数据分析相关技能及学习方法,能进行分子、基因组和群落各层次的基本大数据分析,并扩大了自己的科研朋友圈。其中张家豪、温顺浪、林晓峰、周钰禧、谭金潇五名学员表现突出,被评为优秀学员。
优秀学员
“为实验室引入技术火种,打造同学心目中的实用型金课”是《生物大数据分析》公益培训班的开设初衷,也是授课团队将一直秉承的理念。相信未来的《生物大数据分析》将会不断升级,为更多的学员带来掌握上手技能的机会,成为同学们心目中的实用型金课!也希望本培训课程能抛砖引玉,启发更多课程改革,共同推进中国研究生教育质量的持续提升。
证书编号 | 姓名 | 单位 | 导师 |
LOEG-7-236 | 张家豪 | 中国海洋大学 | 高勤峰 |
LOEG-7-237 | 温顺浪 | 中国海洋大学 | 艾庆辉 |
LOEG-7-238 | 林晓峰 | 中国海洋大学 | 田相利 |
LOEG-7-239 | 周钰禧 | 中科院水生生物研究所 | 黄洁 |
LOEG-7-240 | 谭金潇 | 中国海洋大学 | 周演根 |
LOEG-7-244 | 卜纪远 | 中国海洋大学 | 绳秀珍 |
LOEG-7-245 | 曹曼霞 | 中国海洋大学 | 何艮 |
LOEG-7-246 | 陈娟 | 中国海洋大学 | 汪岷 |
LOEG-7-247 | 陈泽坤 | 中国海洋大学 | 王巧晗 |
LOEG-7-248 | 初凡智 | 中国海洋大学 | 孔令锋 |
LOEG-7-249 | 邓如云 | 华中师范大学 | 叶志强 |
LOEG-7-250 | 翟志昊 | 中国海洋大学 | 田苗 |
LOEG-7-251 | 董智玲 | 中国海洋大学 | 孙鹏 |
LOEG-7-252 | 冯晓晨 | 中国海洋大学 | 胡晓钟 |
LOEG-7-253 | 高晓薇 | 中国海洋大学 | 李丽 |
LOEG-7-254 | 葛睿吉 | 中国海洋大学 | 梁彦涛 |
LOEG-7-255 | 郭盈 | 中国海洋大学 | 杨雨佳 |
LOEG-7-256 | 何琨 | 中国海洋大学 | 王芳 |
LOEG-7-257 | 皇甫一凡 | 中国海洋大学 | 郑小东 |
LOEG-7-258 | 蒋泓桢 | 中国海洋大学 | 王媛媛 |
LOEG-7-259 | 蒋明灿 | 中国海洋大学 | 张文兵 |
LOEG-7-260 | 荆功超 | 中国海洋大学 | 龙红岸 |
LOEG-7-262 | 李孟肖 | 中国海洋大学 | 绳秀珍 |
LOEG-7-263 | 连春禹 | 哈尔滨师范大学 | 独立教师 |
LOEG-7-264 | 刘天美 | 哈尔滨师范大学 | 母伟杰 |
LOEG-7-265 | 青志鹏 | 中国海洋大学 | 汪岷 |
LOEG-7-266 | 曲嘉鑫 | 中国海洋大学 | 孔凡娜 |
LOEG-7-267 | 石瑶 | 中国海洋大学 | 李丽 |
LOEG-7-268 | 宋新宇 | 中国海洋大学 | 胡晓丽 |
LOEG-7-269 | 孙千惠 | 中国海洋大学 | 胡晓钟 |
LOEG-7-270 | 孙晓宁 | 中国海洋大学 | 王巧晗 |
LOEG-7-271 | 田磊 | 中国海洋大学 | 田相利 |
LOEG-7-272 | 田新雨 | 中国海洋大学 | 唐小千 |
LOEG-7-273 | 王嘉璐 | 哈尔滨师范大学 | 潘旭明 |
LOEG-7-274 | 王丽华 | 中国海洋大学 | 郑小东 |
LOEG-7-275 | 王宇航 | 中国海洋大学 | 周演根 |
LOEG-7-276 | 谢松辉 | 中国海洋大学 | 潘鲁青 |
LOEG-7-277 | 许文欣 | 中科院水生生物研究所 | 黄洁 |
LOEG-7-278 | 杨硕 | 中国海洋大学 | 何艮 |
LOEG-7-280 | 尹俊怡 | 中国海洋大学 | 张彦娇 |
LOEG-7-281 | 张天喆 | 中国海洋大学 | 董云伟 |
LOEG-7-282 | 张晓宁 | 中国海洋大学 | 潘鲁青 |
LOEG-7-283 | 张馨文 | 中国海洋大学 | 艾庆辉 |
LOEG-7-284 | 张选召 | 中国海洋大学 | 王芳 |
LOEG-7-285 | 赵晶晶 | 中国海洋大学 | 张彦娇 |
LOEG-7-286 | 周盼 | 哈尔滨师范大学 | 王丽 |
LOEG-7-287 | 朱欢欢 | 中国海洋大学 | 高勤峰 |
LOEG-7-288 | 张昀凡 | 中国海洋大学 | 苏颖 |
LOEG-7-291 | 花晓静 | 中国海洋大学 | 龙红岸 |